Nové prostory rovněž představují historii krytu z druhé světové války, obsahují makety a artefakty zapůjčené z Vojenského historického ústavu. V této části výstavy je umístěna dotyková obrazovka, která interaktivním způsobem přibližuje události druhé světové války v Plzni. Tato expozice je unikátní především proto, že
spojuje jak exponáty zoologické a biologické, tak také historické. Je to zajímavá symbióza i s ohledem na to, že odkazuje na smutnou kapitolu z plzeňských dějin.
Podzemí pevnost na území zoologické zahrady nechala vybudovat německá armáda v letech 1940 -1941, částečně sloužila jako pozorovatelna leteckého prostoru nad Plzní. Prostory krytu se v novou expozici podařilo proměnit v průběhu tří let. Náklady na její vybudování činily 35 milionů korun.