Stavba tak mění svůj účel už poněkolikáté. Původní Pražská burza peněžní a zbožní v průběhu let sloužila jako vojenské skladiště, zázemí divadla, lazaret, parlament a sídlo rozhlasové stanice. Nejvýraznější přestavba budovy proběhla v 70. letech, kdy starou burzu doplnila přístavba a k ní ještě nadstavba. Od roku 1995 z ní vysílalo rádio Svobodná Evropa. Rozhlasová stanice se ale vloni z centra Prahy odstěhovala a budovu na začátku června 2010 předala Národnímu muzeu.
Muzeum se nyní snaží budovu co nejvíce otevřít, protože v minulosti byla víceméně nepřístupná, ať už jako komunistický parlament či jako rozhlasová stanice, kterou hlídalo komando ozbrojenců proti teroristům. Dnes je návštěvníkům hned u vchodu k dispozici "museum shop" a kavárna.
Nová budova Národního muzea láká nyní na výstavu prací autora této kontroverzní budovy Karla Pragera Město nad městem, která potrvá do 17. dubna. Probíhat budou zároveň i komentované prohlídky.
Budova „rádia Svobodná Evropa“bude, z důvodu rekonstrukce historického objektu, až do roku 2015 jediným prostorem výstav a expozic Národního muzea.